在整個施工中，有些潔淨工程主要的錯誤有設計錯誤，施工過程粗糙，不正確的維護和管理等方麵。為了進一步加強對淨化空調係統的監督管理，使設計、施工、運行等各階段都能各盡其職，確保淨化係統能夠良好的運行，根據實際工作經驗，本文潤德淨化提出幾個設計施工過程中需要注意的問題。
1.潔淨等級的劃分
掌握潔淨度的分類標準是潔淨室設計和建造的第一步。目前，由於各種國內標準對清潔等級的定義不同，因此，潔淨工程應充分了解其中的異同，避免在工程中出現錯誤。目前我國常用的潔淨標準有《潔淨廠房設計規範》和《醫院潔淨手術部建築技術規範》。在潔淨廠房規範中劃分為1-9級潔淨標準。
潔淨工程標準對不同控製顆粒尺寸的最大濃度限值有明確的要求。例如，5級，要求的是大於或等於0.5μm的最大濃度限值為3520pc/m3，大於或等於0.3μm的最大濃度限值為10200pc/m3。而潔淨工程規範中是直接以0.5μm為要求進行控製的粒徑。例如，潔淨度100級的要求為，大於或等於0.5μm的塵粒數大於350粒/m3到小於等於3500粒/m3。這個與潔淨廠房規範中要求的5級標準基本相同。
比較潔淨工程中的兩個淨化部門，可以看到潔淨室和潔淨操作部門之間的相應清潔度等級分別為5級（100級），6級（1000級），7級（10,000級）和8級（100,000級）。故在設計時，應明確潔淨室或潔淨區空氣潔淨度等級要求。另外，在《通風空調工程施工質量驗收規範》中，應用的是潔淨廠房1~9級標準，因而在潔淨工程施工過程中，需弄清楚其相對應的潔淨等級要求。以便施工過程中嚴格按照相應等級要求進行施工和相關功能性試驗。
2.潔淨工程的後期維護
潔淨工程中的空調係統需要控製室內溫、濕度，灰塵，有害氣體濃度和氣流分布，保證室內人員所需的新風量，並維持室內外合理的氣流流向，其中最為重要的是控製室內細菌的濃度。比較而言，工業潔淨空調係統潔淨度控製則更偏重於塵粒的控製。
同時，因為不同的應用行業，即使是同一級別的淨化工程也有不同的要求。您還應該熟悉每個行業的特征，充分掌握各規範的要求，才能切實做好生物潔淨工程的設計、施工、調試等工作。如《軍隊醫院潔淨護理單元建築技術規範》、《藥品生產質量管理規範》和《無菌醫療器具生產管理規範》等。